El hospital se construyó en el 1562 al lado de la Capilla del Deán Duque de Rivera. Hospital e iglesia fueron quemados y saqueados por el corsario Francis Drake en el año1586.
Algunos siglos después se reconstruyó el hospital cual fuera casa de corrección y sostén a las mujeres con necesidad. Sirvió como puesto de guardia y de cárceles, hasta cuando en 1880 el canónico Francisco Xavier Billini, convirtió el hospital en casa de beneficencia y reedificó la capilla, que exhibe una sobria fachada, del siglo XVIII.

En ella se encuentran sepultados los restos del hombre que con tanto mérito gobernó la ciudad: Doctor Pedro Antonio Delgado.

Notas Arq.: La comunicación hospital-iglesia se efectúa a través de un arco de herradura (Gótico-Mudéjar). La bóveda, construída totalmente de ladrillos. Adorna el altar un estupendo retablo barroco, tallado en madera, de la segunda mitad del siglo XVII; a los lados dos figuras con barbas.